Wegen einer Bombenentschärfung in Osnabrück wird die Eisenbahnstrecke im Bereich Osnabrück Hasetor am 04.01.2009 zeitweise für den Zugverkehr gesperrt. Für die Züge der Westfalenbahn fahre Ersatzbusse zwischen Osnabrück Hbf und Ibbenbüren-Laggenbeck.
Die Westfalenbahn veröffentlichte eine entsprechenden Ersatzfahrplan.
Am 14.12.2008 ist Farhplanwechsel. Der Fahrplan 2009 bedeutet für Osnabrück Veränderungen im Fernverkehr während die Nahverkehrssysteme von DB Regio, NordWestBahn und Westfalenbahn weitgehend im Status Quo bleiben.
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Die bisherige IC-Verbindung von Berlin nach Amsterdam bzw. Münster wird ab Fahrplanwechsel im 2-Stundentakt von Berlin nach Amsterdam nach Berlin durchgebunden (nach Amsterdam zwischen 07:53 und 19:53; nach Berlin 08:08 und 20:08). Die Halte Bünde und Bad Oeynhausen werden alternierend bedient.
Bestehen bleibt die tägliche Direktverbindung von und nach Szczecin Glowny.
Zusätzlich verbleibt in Tagesrandlage ebenfalls die Direktverbindung Münster – Berlin (06:04 ab Osnabrück) und zurück (22:01 ab Osnabrück).
An Freitagen wird es ab Fahrplanwechsel mit dem IC 1922 eine Verstärkungsleistung von Köln über Osnabrück nach Berlin-Südkreuz geben (15:57 ab Osnabrück Hbf). Dieser Zug hat keinen planmäßigen Halt bis Hannover Hbf.
Im Nachtverkehr entfällt der CNL 408 / 409 Komet, der Hamburg mit Zürich verbunden hat. Diese Zugleistung wird neu über Hannover / Frankfurt geführt. In diesem Zuge entfällt die Verbindung CNL 236 / 237 Andromeda von Hamburg nach Paris ersatzlos.